단백질 소수성 코어 호박빛 내부 — Molecules

접힌 단백질의 가장 깊숙한 심장부에 존재한다는 것은, 사방 몇 옹스트롬 이내에 굽은 분자 표면이 끊임없이 밀려드는 세계 속에 갇힌다는 의미다 — 류신과 이소류신의 창백한 상아빛 가지들이 3.5~4.0 Å의 C-C 접촉으로 맞닿으며 따뜻한 호박빛 금색을 발산하고, 페닐알라닌의 납작한 방향족 고리들은 희미한 백금빛 인광 속에 서로 엇갈려 쌓여 있으며, 그 사이로 트립토판의 쌍환 인돌 고리가 깊은 청록색 π전자 광채를 터뜨리며 주변 사슬을 차가운 군청 빛으로 물들인다. 이 공간의 충전 밀도는 0.74에 달해 보석을 세공하듯 정밀하게 맞물린 분자들이 단 하나의 빈틈도 허락하지 않으며, 매장된 메티오닌 황 원자는 유기적 질감 사이에서 날카로운 황금빛 금속 광택으로 빛나는 작은 구슬처럼 박혀 있다. 지각의 가장 먼 경계 — 이 세계에서는 불과 15~20 Å 떨어진 곳 — 에서 단단했던 호박빛 압축이 서서히 풀리며 수소결합으로 엮인 물 분자들의 희뿌연 청회색 안개가 스며들어, 단백질 소수성 핵의 완벽한 차폐와 수성 세계의 열린 용해 사이에 존재하는 절대적 경계를 감각으로 알린다.

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