クリスパーによるDNA探索
Macromolecules

クリスパーによるDNA探索

眼前に広がるのは、生きた鉱物から彫り出された大聖堂のような巨大なタンパク質複合体の正面――Cas9の全体像であり、コバルトブルーと深いティールが交錯する認識ローブが頭上に迫り、温かみのある琥珀色と黄土色の核酸分解ローブが眼下に膨らみ、その二葉の間にB型DNAの二重らせんが氷青の撚り綱のように挟み込まれている。らせんのリン酸骨格は冷たい紫色の発光を帯びたノードの連なりとして輝き、その周囲では水分子が微細な衛星球として揺れながら淡い光を四方へ散乱させ、溶媒との境界が固定された輪郭ではなく「交渉によって決まる領域」として常に拡散している。エレクトリックシアンの一本鎖ガイドRNAがローブ間の空間を斜めに横切り、その近傍ではすでに三箇所のRループ架橋が形成されており、RNAと鋳型鎖DNAを引き寄せる水素結合が金白色の繊細な光の糸として視覚と電場感覚の両方に訴えかけてくる。右側の核酸分解ローブではPAM認識ドメインの二本のアルギニン側鎖がNGGトリヌクレオチドのマイナーグルーブへ指のように挿入され、HNH活性部位とRuvC活性部位の深部では二価マグネシウムイオンがグルタミン酸とヒスチジンの酸素配位子に囲まれた正八面体の檻の中心で白熱点として輝いており、DNAを切断するための化学的引力が今まさに臨界点に達しようとしている様子が、全方向から押し寄せる熱的ゆらぎの燐光の霞の中に浮かび上がっている。

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